È stata raggiunta il 22 settembre 2006 l'intesa tra il Governo e le Regioni relativa a un nuovo “Patto per la Salute” di valenza triennale. Il Patto si compone di un aspetto finanziario e di un aspetto normativo e programmatico. L’accordo, siglato dal Ministro della Salute, dal Ministro dell’Economia e dal Presidente della Conferenza delle Regioni, punta alla riduzione degli sprechi, alla stabilizzazione della spesa e al miglioramento della qualità dei servizi e delle prestazioni, anche attraverso il superamento del divario
tra nord e sud con particolare riferimento all'assistenza oncologica e alle malattie rare.
Queste le sue maggiori caratteristiche: adeguamento dello stanziamento pluriennale il cofinanziamento degli investimenti nel SSN in modo da consentire la definizione di nuovi accordi di programma per la qualificazione delle strutture sanitarie, l'innovazione tecnologica e il superamento del divario Nord-Sud; aggiornamento dei LEA (Livelli Essenziali di Assistenza sanitaria) ai nuovi bisogni di assistenza; riorganizzazione e potenziamento della rete delle cure primarie, mediante la promozione di forme volute di associazionismo tra i medici di medicina generale e di integrazione con l'attività dei distretti sanitari; sviluppo dell'integrazione socio-sanitaria a partire dall'assistenza alle persone non autosufficienti; riorganizzazione e umanizzazione della rete ospedaliera, finalizzata anche al recupero di maggiore efficienza nell'utilizzo delle risorse nelle Regioni.